動物疫病傳播有三個環節：傳染源、傳播途徑、易感動物。在動物防疫工作中，只要切斷其中一個環節，動物傳染病就失去了傳播的條件，就可以避免某些傳染病在一定范圍內發生，甚至可以撲滅疫情、最終消滅傳染病。但對規模養殖場來說，消滅傳染源、保護易感動物只是防疫工作的兩個重要方面，只有做好隔離工作，切斷傳播途徑才是防止重大動物疫情發生的最關鍵措施。
1、為什么要強調隔離工作的重要性
1.1、目前條件下無法徹底消滅傳染源
我國是一個養殖業大國，家畜、家禽的存欄量位居世界首位，但畜牧業的生產方式相對落后，現階段主要牧區牲畜的放養比例較大，中西部地區農村畜禽的散養比例平均超過50%。由于基層獸醫站管理體制落后、人員數量和整體質量不高，多數農民無獸醫專業知識，動物防疫法制觀念淡薄，缺乏對防控重大動物疫病重要性的認識，往往將病死動物尸體隨意丟棄、食用，甚至有一些不法分子收購病死動物尸體加工后運往城市銷售，人為導致病原擴散和傳播。同時，大量畜禽及其產品長途調運以及候鳥遷徙等因素，難免有患病動物將病原傳播到各地。國務院、地方各級政府和各級獸醫部門雖然采取了一些措施，有效地控制了重大動物疫病的發生和蔓延，但高致病性禽流感等重大動物疫病的病原并沒有被消滅，甚至在定范圍內長期存在。因此，在目前的條件下消滅傳染源只是控制動物傳染病的社會性措施之一，對防控全社會的重大動物疫情暴發具有重要意義，但對規模養殖場的動物防疫作用有限。
1.2、注射疫苗對動物的保護率達不到100%
受細菌的致病力、病毒毒力、動物的母源抗體、動物本身的營養、飼養環境、健康狀況、免疫程序等因素的影響，往往導致疫苗免疫注射的抗體保護率只能達到一定比例，保護率不能達到絕對的100%;受免疫時機、免疫方式等因素的影響，疫苗的免疫保護率一般只能達到70%～80%左右，這是獸醫工作者和養殖場技術人員都了解的常識。因此，政府采取集中免疫注射的方式，只能提高全社會整體動物的免疫力，大大減少動物疫病在社會上傳播的范圍和速度，可以控制社會范疇的重大動物疫情，但對規模養殖場的疫病防控起不到決定性的作用。因為，養殖小區和規模養殖場多建在交通方便、人口密度大、便于原料采購和產品銷售的區域，很容易受到外界病原的侵襲。在這種情況下，由于養殖場采用規模化飼養，畜禽密度高，只要有少量動物沒有免疫力，疫情便可以快速在場內傳播，并且在傳染病發生的初期，病原的致病力逐漸增強，然后向附近擴散。生產實踐已經證明，雖然絕大多數的養殖場都十分重視免疫接種工作，但多數新發疫情是在病原的致病力增強后從規模養殖場傳到附近農戶，或僅在養殖場之間傳播，受危害最大的是規模養殖場。例如，二十世紀八十年代以來國內新發的多種動物疫病均是規模養殖場從國外引進，然后才在社會上傳播。
1.3、嚴格隔離是防止病原傳入規模養殖場的有效途徑在無法徹底消滅傳染源、疫苗的免疫保護率達不到100%的情況下，做好隔離工作更加重要，這也是在生產實踐中被證明是切實有效的方法。
一般來講，危害較大的重大疫病一般都有一個共同特點，即凡是傳播快、發病率高、致死率高的疫病，如高致病性禽流感、病毒性非典型性肺炎、鼠疫等重大疫病多為急性、熱性、接觸性傳染病，雖有通過空氣傳播的可能性，但只要不與患病個體、運輸工具、有關人員等傳播媒介或病原直接或間接接觸，一般不至于感染。也有專家認為一些病原體能隨風傳播數十甚至上百公里的說法，但生產中無法證實。一般通過塵埃傳播的疫病可能傳播比較快、危害范圍廣，但后果一般不是很嚴重，不屬重大動物疫病的范疇，如在現階段普通流感等疫情雖然傳播快、傳播范圍廣，但危害并不是十分嚴重，并且容易控制。因此如果規模養殖場預防重大動物疫病，從理論上來講只要做好隔離工作就可以取得顯著成效。
2、規模養殖場做好隔離工作的原則和主要措施
做好規模養殖場的隔離工作，可以借鑒生產SPF動物及產品的做法，重點做好以下方面的隔離工作：
2.1、自然環境隔離
建場選址應離開交通要道、居民點、醫院、屠宰場、垃圾處理場等有可能影響動物防疫因素的地方，養殖場到附近公路的出路應該是封閉的500米以上的專用道路;場地周圍要建隔離溝、隔離墻和綠化帶;場門口建立消毒池和消毒室;場區的生產區和生活區要隔開;在遠離生產區的地方建立隔離圈舍;畜禽舍要防鼠、防蟲、防獸、防鳥;生產場要有完善的垃圾排泄系統和無害化處理設施等。山區、島嶼等具有自然隔離條件的地方是最理想的場址。
2.2、規模養殖場要建立獨立的隔離區
一般規模養殖場都設有隔離區，用于對本場患病動物和從外界新采購動物的隔離，但往往達不到預期效果。因為這些隔離區都建在生產區的范圍內，與養殖場的人員、道路、用具、飼料等方面存在各種割不斷的聯系，因此形同虛設。建議重新認識隔離區的涵義，建立真正意義上的、各方面都獨立運作的隔離區，重點對新進場動物、外出歸場的人員、購買的各種原料、周轉物品、交通工具等進行全面的消毒和隔離。
2.3、與外界動物和病原微生物隔離
規模養殖場要貫徹"自繁自養、全進全出"的方針，避免引進患病和帶毒動物，避免將患病和帶毒動物遺留到下一批畜禽。引進種用動物要慎重，絕對不能從有疫情隱患的單位引進種畜禽;新引進的動物要執行嚴格檢疫和隔離操作，確屬健康的才能混群飼養。禁止養殖場的從業人員接觸未經高溫加工的相關動物產品。
2.4、人員隔離
做好人員隔離對防控重大動物疫病具有十分重要的意義。生產人員進入生產區時，應洗手，穿工作服和膠靴，戴工作帽;或淋浴后更換衣鞋。工作服應保持清潔，定期消毒。飼養員嚴禁相互串棟。在外界（主要指國內）有疫情發生的情況下，嚴禁生產人員外出;必須外出的，要經過主要領導批準。人員一旦外出，有必要待疫情全部撲滅后才可進場，或經過嚴格的隔離和消毒后才能進場。生產人員和非生產人員也要進行隔離。非生產人員原則上不能外出。嚴禁所有人員接觸可能攜帶病原體的動物及產品加工、販運等人員。要堅決出售因故出廠或與外界接觸的動物。
2.5、飼料、用具和交通工具隔離
禁止飼喂不清潔、發霉或變質的飼料。不得使用未經無害化處理的泔水以及其他畜禽副產品。飼養員認真執行飼養管理制度，細致觀察飼料有無變質、注意觀察豬采食和健康狀態，排糞有無異常等，發現不正常現象，及時向獸醫報告。養殖場必須定期開展采購飼料、出售產品等工作，這些環節是傳入疫情的關鍵環節，不能出現任何漏洞。采購飼料原料要在非疫區進行，參與原料運輸工具和人員必須是近期沒有接觸相關動物及產品的，原料進場后在專用的隔離區進行熏蒸消毒。杜絕同外界業務人員的近距離接觸，杜絕使用經營商送上門的原料，杜絕運輸相關動物及產品的交通工具接近場區，決不允許返回場內。
2.6、建立和遵守完善的隔離制度
要針對防疫工作建立完善的人員管理制度、消毒隔離制度、采購制度、中轉物品隔離消毒制度等規章制度并認真實施，切斷一切有可能感染外界病原微生物的環節。
文中提到的只是隔離工作的一些主要方面，實際生產中涉及很多方面和具體細節，只有做好每個環節的工作，才能杜絕外界疫情傳入的可能。