（一）保健措施
1 ．加強飼養管理 加強水蛭的日常飼養管理，創造適合于水蛭生活的良好條件，提高水蛭對病害的抵抗力，這是防治水蛭疾病的根本措施。
水蛭的場地要選擇資源條件好，包括食物資源、水資源，同時還要考慮到向陽、保暖、防暑降溫等條件。
水蛭的餌料要清潔衛生，品質優良，合乎各種營養的需要，只有食物的營養全面才能生產出合格的水蛭產品。因此提高食物質量是保證水蛭健康生長繁殖，增強抗病能力，預防疫病傳染的一個基本環節。
2 ．選育優良品種 水蛭對疾病抵抗力的強弱，是疾病能否發生及發生輕重的決定因素之一。因此，有目的、有計劃地注意觀察水蛭的健康狀況，從中選育出抗病性較強的品種，同時注意淘汰發育慢、抗病能力弱的水蛭，使之逐漸純化，以達到選育良種的目的。
3 ．遵守衛生規則 衛生規則是水蛭養殖場預防措施的重要內容之一。在生產中要遵守各項衛生規則，講究衛生，預防傳染性疾病的發生與傳播。水蛭養殖場的衛生規則，大體包括以下幾個方面。
一是場地和用具的清潔衛生。包括餌料臺、放料的器具等，要隨時收集清理，不能到處亂扔。
二是養殖人員要注意個人衛生。衣服要保持清潔，操作前后要用肥皂洗手，進人場地要進行全面消毒等。
三是物料保存完好。包括餌料、藥品等物品，應保存在嚴密的庫房內，防止發生破損和丟失。
四是不用帶有病原物或情況不明的食物作餌料，防止傳播疾病。
五是時刻注意水蛭的健康情況，發現個別水蛭有可疑情況時要及時隔離觀察，查明病因，及時治療。
（二）預防措施
1 ．檢疫 引進新品種時，應將水蛭單獨飼養并送交有關技術檢疫或檢驗部門進行檢疫，確認健康再與原有水蛭混養。在養殖期間，也要定期進行檢疫，及時發現病情。否則將生產出不合格的產品，而蒙受經濟損失。
2 ．消毒 消毒就是消滅外界的病原體，也是對傳染性疾病的一項防治措施。
根據消毒的目的，可分為預防性消毒、隨時性消毒和最終消毒。
預防性消毒是為預防某些傳染病的傳入而進行的。每個養殖池無論發病與否，均應采取消毒措施，特別是當鄰近地區有傳染病發生或受到傳染病威脅時，更要加強預防性消毒。
隨時性消毒是在傳染病已經發生時，為了防止病原的積累和散布而進行的消毒，包括場地、餌料架、用具等方面的消毒處理。最終消毒是在解除對發病水蛭場地的隔離之前，為徹底消除傳染病原而進行的消毒，包括有可能被污染的物體全部進行消毒處理。
消毒的方法有多種，但常用的有機械消毒、物理消毒和化學消毒3 種。
機械消毒：就是清潔掃除，包括灑掃、清理、鏟刮、洗滌等方法，以除去物體表面的大部分病原物。物理消毒：包括日曬、烘烤、灼燒、煮沸、蒸氣和紫外線燈照射等方法。例如曝曬飼料臺，烘烤飼養用具，用沸水或高壓蒸氣消毒衣服、蓋布以及用具，用紫外線燈消毒倉庫等。
化學消毒：是利用化學藥劑消毒，這種消毒方法應用比較廣泛。常用的消毒劑有：
燒堿（苛性鈉）：可用l ％～3 ％燒堿溶液趁熱洗刷用具等物，然后再用清水洗凈、晾干。
蘇打（食用堿、碳酸鈉）：小型用具、工作服、蓋布等物，可用2 ％～5 ％蘇打溶液洗刷。消毒后的物品要用清水洗凈、晾干。
漂白粉（含氯石灰）：可用5 ％漂白粉水溶液消毒養殖場地、倉庫、辦公房屋等。漂白粉要密封在木塞玻璃瓶或塑料袋內，貯存于陰暗、干燥、風涼的房屋中，不可久藏。溶液要隨用隨配，調配和噴灑時要戴口罩。石灰乳：將生石灰（塊灰）加水化開，配制成10 % ～ 20 ％石灰乳，可作場地和走廊的消毒劑。
福爾馬林：福爾馬林是含40%甲醛的水溶液，是一種殺菌力很強的消毒劑。應用時常用其稀釋水溶液或蒸氣來消毒用具等物。福爾馬林對眼、鼻和呼吸道的粘膜有強烈刺激性，使用時必須注意安全。
冰醋酸：冰醋酸的蒸氣可用于熏蒸消毒，可殺滅很多病原體。可以在放養以前，把門窗糊嚴，然后把冰醋酸灑在地上，立即密封熏蒸。冰醋酸的用量，含量在98 ％以上的，每立方米用量100 毫升；含量在80 ％的，應增加至120 毫升。室溫在18 ℃ 以上，熏蒸數小時至一夜即可通風；溫度較低時，需熏蒸3 ～ 5 天。食鹽飽和溶液：以每升水加食鹽360 克制成食鹽飽和溶液。浸泡用具1 天，再用清水洗凈、晾干，有殺蟲防病害的作用。
二氧化硫：二氧化硫是燃燒硫黃所產生的氣體。除對蟲卵有很強的殺傷作用外，常用以消毒被霉菌污染的用具等。消毒方法和冰醋酸基本相同，每立方米用量為3～5 克硫黃。使用時，將已燃燒的木炭數塊放在一個瓦盆內，放入要消毒的空間（如日光溫室等），再將硫黃倒在炭火上，并立即封好門窗，密閉熏蒸24 小時后開門窗通風。