為保證沼氣細菌有充足的食物和進行正常的新陳代謝，使產氣正常而持久，就要不斷地補充新鮮的發酵原料，更換部分舊料，做到勤加料、勤出料。
進出料的數量 根據農村家用池發酵原料的特點，一般每隔5~10天進、出料的各5%為宜。也可按每立方米沼氣量進干料3~4kg計算。對于“三結合”的池子，由于人、畜糞尿每天不斷自動流入池內，因此，平時只需添加堆溝后的糞便發酵原料和適量的水，以保持發酵原料在池內的濃度。同時也要定期小出料，以保持池內一定數量的料液。
平時進、出料應注意的問題：
1、 原則上是出多少進多少，順序為先出后進；
2、 出料時應使剩下的料液液面不低于進料管和出料管的上沿，以免池內沼氣從進料管和出料管跑掉；
3、 出料后要及時補充新料，若一次發酵原料不足，可加入一定數量的水，以保持原有水位，使池內沼氣具有一定的壓力。
大換料應注意的問題為滿足沼氣菌的新陳代謝和農用季節用肥的需要，一般大換料的時間應安排在春季和秋季進行。
1、 大換料前20-30天，應停止進料，以免浪費發酵原料。
2、 大出料后應及時加足新料，使沼氣池能很快重新產氣和使用。
3、 大出料時應清除沼氣池內的全部殘渣和部分料液，要留下10%-30%以活性污泥為主的料液作為接種物，以加快沼氣池的啟動，做到產氣快！