1. 屏障體系已經建立，但仍未清晰：
1.1 豬場在選址時，就應考慮到一個天然的大環境屏障，周邊應無其他飼養場及肉類加工廠，距鬧區相距至少2公里以上。
1.2 對周邊農戶飼養豬只及時進行接種免疫，形成一個龐大的免疫隔離帶，因為城池失火，往往殃及池魚。
1.3 養殖場內部屏障不清晰，未產生應有的防疫作用，特別是生產區的辦公區域與生活區劃分不清晰，形成一個防疫隱患區域。
1.4 生產區員工實質上進出豬舍腳踩消毒桶的較少，消毒桶一般是給來檢查工作的領導用的。
2. 消毒：
消毒是保障豬場安全生產的一個非常重要的措施，豬場的許多病原微生物可以通過消毒工作來達到殺滅和抑制其傳播的效果。但是，在實施消毒的過程中往往會走入以下幾個誤區。
2.1 消毒藥濃度越大越好：任何消毒藥濃度的配比，都具有其一定的科學性和合理性。在正常情況下，無論是環境消毒還是帶豬消毒，正常的濃度配比就足以殺滅和抑制病原菌的繁殖和傳播。如果消毒藥的濃度過大，一方面造成消毒藥的浪費，增加飼養成本;另一方面很容易導致豬的皮膚、粘膜、呼吸道的損傷，同時也有可能造成人員的傷害。
2.2 消毒藥的濃度配比不準確：在生產過程中，由于工作人員責任性不強或其它原因，在對消毒液的配制過程中采取不稱量、不使用固定容積的容器，往往憑感覺，這樣配制出來的消毒液的濃度或高或低，使消毒藥濃度低起不到消毒效果，濃度高不僅造成藥物的浪費，同時也容易造成對豬只和操作人員的傷害。
2.3 消毒不到位、不徹底：豬場工作人員在消毒過程中，往往出現走捷徑的現象，如消毒速度過快、噴灑不均勻、不采取噴霧的方式等，這樣，無論是環境消毒還是帶豬消毒很容易留有死角，不能很好的起到消毒的作用。
2.4 消毒不同步：無論是環境消毒還是帶豬消毒，應盡可能在大致固定的時間范圍內進行。對于一個萬頭豬場來說，全場消毒一次大約在2-3小時內即可完成。所以在對豬場的消毒過程中，各豬舍應同時進行同時結束，能很好的起到消毒的作用。
2.5 對人流、物流、車流的消毒不到位：對于規模化養豬場來講，一般都采用封閉式的管理制度，但是現實決定又不可能完全徹底的封閉，特別是在市場行情不看好的情況下，將養殖場擴大規模時，需要邊生產邊擴建，因此人流、物流、車流進出養殖場頻繁。如何對人流、物流、車流進行徹底的消毒是任何一個養豬場都面對的現實問題。如果這項工作做不到位，是養豬場最大的安全隱患。
2.6 消毒池利用不充分：任何一個養豬場都設置車輛消毒池和員工消毒腳池，但是在實際操作過程中往往出現很大的漏洞，如消毒池消毒藥的濃度不夠、不定期更換消毒液、消毒池消毒液不干凈、員工不走消毒池等;這種現象如不加以杜絕，豬場出現疫情是必然的。
2.7 忽視消毒時的溫度與場地的有機物存在：各種消毒藥在發揮有效消毒效果時，都是有前提條件的，比如在冬季溫度較低時，大部份消毒藥在0℃時失去消毒效果，因此在冬季寒冷季節消毒時，最好采取用溫水進行消毒。
3. 疫苗免疫：
3.1 免疫程序不合理：現階段豬群疫病復雜多樣化，如果豬群的免疫程序制定的不科學、不合理，一方面使豬場的某種疾病漏防，另一方面可能引發其它的疾病，導致豬場出現疫情，給豬場的生產造成不可估量的損失。
3.2 疫苗質量不過關：目前市場上流通的疫苗很多，同一個種類的疫苗就有多個生產廠家，但是質量參差不齊，甚至出現假冒偽劣產品。所以，豬場在選擇疫苗時必須謹慎，應選擇信譽度高、知名廠家生產的疫苗。
3.3 疫苗運輸、保存不科學：由于不同豬場的基礎設施有差別，在疫苗的采購、保存過程中不規范，可能出現疫苗冷鏈的中斷，造成疫苗質量的下降或失效。
3.4 在疫苗免疫過程中操作不規范：豬場應根據已制定的免疫程序，由專人按標準的操作方法進行免疫注射。但是，由于豬場的監督力度不夠或技術人員責任性不強，在操作中往往出現類似情況：疫苗的領取沒有做詳細的記錄;沒有按說明進行嚴格的稀釋或在稀釋過程中受消毒液污染;針頭大小、長度不合適;疫苗沒有防日曬、高溫、稀釋后在3小時內用完;疫苗在使用前或每次吸苗前沒有充分的搖勻;注射時深度沒保證，注射位置不正確，接種劑量不夠，疫苗流出后沒有立即用沾有消毒液的棉球檫拭、消毒，出現打飛針、不是頭頭免疫、不是一豬一個針頭;病豬、瘦弱豬同步免疫等情況，勢必導致免疫失敗結果的出現。
4.引種與隔離不當：如果對新引進的豬隔離措施不當，會對原有豬群的安全生產帶來一定的風險。引進種豬時，要安排適當的隔離舍隔離至少30天以上，30天以后必須與本場淘汰種豬混群隔離飼養15天，并隨時觀察其健康狀況。在隔離期內未發生任何疾病，方可混群飼養。
5.疫病檢測不及時：應進行經常性的疫病檢測工作，以便對場內疫病情況、免疫質量、疫病凈化水平進行監控，同時也為本場的防疫工作提供客觀依據。尤其本地區、本季節爆發和流行嚴重的傳染病更應該加強檢測，以便及時做出反應。同時，對場內使用的疫苗、消毒劑的質量也要進行檢測，以保證確實有效。
6.對豬場整體環境的治理不重視：豬場的環境衛生體系是以防疫保健為基礎，以豬的生物學特性為根據。要求規模養殖場在生產過程中，通過完善豬場內外布局和豬舍內部的工藝設計等一系列措施，給豬群提供一個良好的生長和繁育的環境。定期的對豬體內外進行驅蟲和殺滅蚊蠅和老鼠，消滅疾病的傳播媒介，減少豬只疾病發生的機會。定期清除雜草和填埋陰溝，消滅病原微生物的孳生地。經常保持豬舍內空氣新鮮、干燥、溫度適宜、干凈衛生，可以在很大程度上提高豬群的健康水平。
7.對豬場周圍和場區空閑地進行植樹種草(包括蔬菜、花草、灌木等)綠化環境，對改善小氣候有重要的作用。豬舍若能置于這樣的環境中，帶來的好處是：在寒冷的冬季可使場內的風速降低70%～80%;又能使炎熱的夏季氣溫下降10%～20%;還可將場內空氣中有毒、有害的氣體減少25%;臭氣減少50%;塵埃減少30%～50%;空氣中的細菌數減少 20%～80%。
總之，養豬場綜合防疫體系的建立和實施是一個不斷修改和完善的過程，防疫體系內的眾多環節必須環環相扣、節節相連、步步到位，才能充分發揮綜合防疫體系的作用，保障豬場生產的安全性和效益性。