采收荸薺的最適時期一般在冬至前后，其地上部分葉狀莖枯黃后30天左右為宜。荸薺通過貯藏，可調節市場的淡旺季應市，提高經濟效益。荸薺的貯藏方法主要有以下幾種：
一、缸藏保鮮法
荸薺采挖后，攤放于磚地上12~15天，經適當晾干后，放入室內大陶缸內（不可用腌過菜的陶缸）。陶缸應置于干燥、通風處。每缸貯量約80~100千克，將貯滿荸薺的缸口部加蓋。應注意的是：貯藏于陶缸中的荸薺在貯藏前期呼吸作用旺盛，須把缸蓋揭開，以利通風透氣；在氣溫低冷的冬季，缸內要覆蓋一層稻草保溫；在陰雨天氣，因空氣濕度大，要及時揭蓋排濕；炎熱高溫季節，要及時加蓋，以防荸薺球莖體內水分蒸發引起干腐。在貯藏過程中，每隔25~30天須將陶缸內貯藏的荸薺翻動檢查1次。按此方法貯藏，荸薺的保鮮期可達半年以上。
二、窯藏保鮮法
如果使用舊窯貯藏，在貯藏之前，應在窯底及窯身噴2.5%的多菌靈或40%-甲基托布津400~500倍液進行消毒。在窯底鋪一層細土，每放20~25厘米厚的荸薺，其上撒上一層干細土，如此一層果實撒一層土，直至離窯口20厘米為止，其上封干細土填口，周圍用30厘米厚的泥土封頂，形成中央高、四周低的饅頭形，蓋過窯口、拍實。
三、沙藏保鮮法
荸薺收挖后，在陰涼的房屋或地下室內用磚砌，個埋藏坑，在坑底部先鋪5~7厘米厚的細沙，將荸薺球莖排列在沙面上，蓋細沙3~4厘米厚，再排放荸薺球莖，如此一層一層堆疊，堆高不超過1米。這種方法也能起到良好的貯藏保鮮效果。
四、溶液保鮮法
將采收的荸薺球莖去除雜物，清洗后迅速浸入次氯酸鈉溶液中貯藏。據試驗，使用該法，當溫度處于0~2℃、相對濕度在90%~100%的貯藏環境下荸薺球莖的保鮮可達10個月，在5℃以下貯藏保鮮期可達6~8個月。
五、堆藏保鮮法
選擇陰涼室內的土質地面為宜，其大小可根據貯藏數量而定。首先在地面鋪一層干細土，四周用席子圍好，或者用磚砌成池狀，然后一層荸薺一層干細土，層層相間。