無論是人工引種或是從野外采集來的種苗，在放入種池前都要進行隔離消毒處理。以免感染病菌，造成成活率降低。
一、 飼養隔離
無論從何種途徑引進的種苗在入種池前都要與原種池隔離飼養幾天，經過幾天的觀察，如無死亡、厭食、活動力弱、體色變暗、體態異常、體表失去光澤或無彈性等現象，才方可放入正常的種苗池里飼養或 和其它的水蛭混養。
二、 藥物消毒
1、 食鹽消毒
種蛭在放入隔離池之前要進行體外消毒，一般用3%的食鹽水消毒15分鐘即可
2、 漂白粉消毒
漂白粉除可消毒養殖池，也可消毒水蛭。在水溫10到15度時用8－10毫克/升的藥液消毒10－30分鐘即可。
3、 福爾馬林消毒
用0.5－1%的福爾馬林溶液清洗水蛭，消滅一切病原體。