1.生物化學與分子生物學（博士授權點）本專業畢業生可以從事病毒基因組結構功能及其開發利用、抗病毒基因工程、水稻功能基因組、植物基因德調控及信號傳導、植物轉錄因子基因的功能、植物系統獲得抗性和植物抗病的分子機制及其信號傳導途徑，植物抗病機制的超微結構與細胞化學等研究管理工作。
2.生物物理學（博士授權點，國家重點學科）本專業畢業生可以從事DNA損傷修復機制、動物生產管理、污染物環境行為評價、污染物生態、轉基因作物生態風險性評價、利用離體誘變技術、基因工程技術進行作物品種改良和抗蟲品種選育等研究管理工作。
3.作物學（博士授權點，作物遺傳育種專業為國家重點學科）本學科包括作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種兩個二級學科，畢業生可以從事基因克隆和分子育種、生物信息學與數量遺傳、優異種質創新與種子產業化、作物優質安全生產與可持續發展、作物逆境分子生理與調控等方向的研究管理工作。
3.園藝學（農學博士授權點，國家重點學科）本學科包括果樹學、蔬菜學、茶學三個二級學科，畢業生可以從事園藝植物基因組研究與改良；園藝植物逆境生理及其調控；園藝產品品質與安全保障；園藝植物生物化學與有效成分利用等方面的研究管理工作。
4.植物保護學科（博士授權點，國家重點學科）本學科包括植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治、農藥學、環境生物學四個二級學科，畢業生可以從事基礎昆蟲學與植物病原學、有益生物資源的保護和利用、植物-病蟲互作機理和抗病蟲生物技術、有害生物綜合治理、外來有害生物的監控等方面的研究管理工作。
5.園林植物與觀賞園藝（碩士授權點）主要培養生態與植物景觀規劃設計原理、園林植物生理調控與景觀應用、風景園林規劃設計及其理論等研究方向的碩士生，能從事園林植物和花卉資源、園林植物和花卉產業化、植物景觀設計、景觀生態與景觀規劃、球根花卉生理等研究管理工作。
6.應用生物科學專業（農學） 本專業以現代生命科學、信息技術與工程技術等為基礎，以生物技術為核心，培養學生利用現代高新技術，解決生物資源利用、食品、醫藥、環境保護等相關領域問題的能力。
7.應用生物科學專業（理學） 本專業以生物物理和生物技術的新知識和新方法為核心教學內容，注重培養學生的創新思維、基礎理論和技術開發能力。
8.風景園林專業    本專業主要培養從事風景園林規劃設計、風景園林建設管理、園林植物產業的高級工程技術人才。