目前對益生素作為飼料添加劑的研究大多集中在其單獨使用對畜禽生產應用上的效果影響，而益生素與其他飼料添加劑配伍的研究報道多停留在與抗生素、蛋氨酸銅等添加劑上，益生素同其他綠色飼料添加劑的科學組合使用效果更佳。
1 益生素和酶制劑配伍使用
    益生素和酶制劑具有很強的協同作用。益生素可以作為酶的重要來源并提高酶制劑的活性。芽孢桿菌制劑具有很強的蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶活性，同時其也可產生動物本身不能分泌的木聚糖酶、纖維素酶等。益生素在提高酶制劑活性方面效果顯著，有報道顯示，分別在仔豬及鯉魚的飼料中飼喂益生素制劑后，仔豬小腸內的α-蔗糖酶、乳糖酶、三肽酶及鯉魚體中淀粉酶和蛋白酶的活性都顯著提高。徐建雄等和Jin在對生長豬及肉仔雞的研究中得到了相似的結果。酶制劑可促進益生菌增殖，酶制劑通過催化作用促進了食物和飼料的分解，不僅為動物提供了大量的營養物質，同時也為益生菌生長繁殖提供了必需養分。

 劉長忠等發現，在飼料中添加酶制劑0.1%~0.2%，添加水平越高，烏肉雞的生產性能及經濟效益越好，與之組合添加的微生態制劑處于較高水平，說明微生態制劑和酶制劑之間有較強的互作關系。
    近年來的研究表明，益生素與酶制劑組合在水產養殖、養禽業等領域應用前景廣闊。周克勇等和劉長忠都采用U5(54)均勻設計試驗，將芽孢桿菌和酶制劑以0.4%+0.05%、1.0%+0.15%、0.1%+0.25%、0.7%+0.35%、1.3%+0.45%水平組合分別添加在鯉魚和草魚的飼料中，飼喂30d，結果表明，添加芽孢桿菌在0.52%~0.69%、酶制劑在0.14%~0.21%的范圍內鯉魚、草魚的生產性能最佳；在肉雞日糧中添加酶制劑0.1%和益生素0.023%，與對照組相比，試驗組日增重和飼料轉化率提高(P<0.001)、腸道食糜黏度降低(P<0.01)、肝臟重量增加(P<0.001)、降低了腹部脂肪重量(P<0.05)。
    斷奶仔豬基礎日糧中組合添加微生態制劑0.5%和酶制劑0.3%，對提高增重、飼料轉化率，預防仔豬腹瀉及提高經濟效益等方面效果顯著。
2 益生素和寡聚糖配伍使用
    寡聚糖不能被宿主及有害微生物消化吸收，卻能選擇性的激活一種或幾種體內有益菌群生長繁殖，被有益菌消化利用，抑制有害菌生長，從而改善宿主健康。益生素的添加可以直接提高畜禽腸道內有益菌群的數量，使其在體內占優勢，而寡聚糖和益生素配伍使用后，則能提高有益菌在腸道內的成活率和定植率，增強有益菌的競爭優勢，改善益生菌的穩定性，促進益生素更好的發揮作用。
    羅曼蛋雞日糧中添加寡聚糖益生素后，可明顯減少雛雞死亡率，提高成活率，促進青年雞的生長，降低雞舍氨氣濃度，改善雞舍環境。在產蛋期使用寡聚糖，可使產蛋期提前5～6d，并很快達到產蛋高峰，降低死淘率。蔣正宇等研究發現，在AA肉雛雞基礎日糧中將益生素與低聚木糖組合添加，比添加抗生素更顯著的提高了肉雞體增重和飼料轉化率，且添加低聚木糖0.01%+益生菌0.005%能有效的提高肉雞空腸乳酸菌數量。另據飼料人才網查閱資料，豬飼糧中添加甘露寡聚糖2mg•kg-1+復合益生素制劑1mg•kg-1，試驗組比對照組的生長速度提高10%，飼料利用率提高9%，在提高生產性能的效果上也顯著優于僅添加寡聚糖的試驗組。
3 益生素和酸化劑配伍使用
    益生素與酸化劑的聯合使用越來越普遍。酸化劑通過降低日糧和動物胃腸道pH，減少營養物質的消耗和抗生長毒素的產生，促進乳酸菌、雙歧桿菌等耐酸益生菌大量繁殖，抑制或殺滅有害菌，改善胃腸道微生物區系，調節微生態平衡，促進動物健康生長。在1日齡仔豬日糧中添加檸檬酸1.5%，胃腸道大腸桿菌的生長受到抑制，乳酸桿菌的繁殖顯著增加，這對仔豬胃酸分泌達到正常水平之前維持其酸性環境及機體健康尤為重要。
    另外，益生菌多為產酸菌和耐酸菌，產生多種有機酸可補充到動物胃腸道中。
    孟宏社等對仔豬生產性能和腹瀉防治的研究發現，酸化劑和益生素合用性效果不明顯，說明益生素與酸化劑需在合適的階段以恰當的比例配伍添加才能很好的發揮協同優勢。周興華等將檸檬酸和益生素按不同比例配伍添加到彭澤鯽基礎飼料中，結果顯示，在基礎日糧中同時添加一定量的檸檬酸和益生素對彭澤鯽有明顯的促生長作用，使彭澤鯽生長性能達到最佳水平的檸檬酸適宜添加水平為0.34%~0.45%，益生素適宜添加水平為0.18%~0.22%。以肉仔雞為試驗對象的多項研究指出，酸化劑和益生素在某一添加范圍內組合使用比兩者單獨添加能更有效的提高平均日增重、飼料利用率、屠宰率、肌肉蛋白含量、生長速率等，增加血液球蛋白含量，升高免疫器官指數，減少胃腸道大腸桿菌數量，提高乳酸桿菌數量，增強機體的免疫性能。蘇軍等研究發現，將益生素0.41%~0.63%和有機酸0.43%~0.64%組合添加對提高肉雞的生產性能效果最佳。
4 益生素和中草藥配伍使用
    中醫學從宏觀上來認識把握生物機體的生命動態平衡，這與益生素調節生物體微生態平衡的作用有共通之處，使得中草藥和益生素有機結合在一起。中草藥可以促進益生菌的增殖，主要是因為中草藥中含有的多種活性多糖、寡糖、有機酸等物質。黃亞東等將茴香、甘草及車前草等13味中草藥制成中草藥飼料添加劑，并與益生菌添加劑結合配制成益生中草藥合劑，結果表明，益生中草藥飼料添加劑在增重、風味、料肉比、成活率及經濟效益等方面均優于其他試驗組。而中草藥中的酸均為有機弱酸，有pH緩沖劑的作用，能維持pH穩定，這也為益生菌的增殖提供了適宜的pH生存環境。有研究表明，阿膠、五味子、枸杞等能促進雙歧桿菌的生長，陳皮、山萸肉、梔子、貫眾對大腸桿菌、沙門氏菌有抑制作用，而對乳酸桿菌均具有促進增殖的作用。黃忠等試驗表明，中草藥益生素聯合應用具有協同增效作用，可有效控制肉雞球蟲病。益生素可以促進中草藥的吸收利用。服用甘草后，具有抗過敏、抗炎癥等類固醇樣作用的主要有效成分甘草甜素并不能直接被機體吸收，而在腸道菌的作用下，其含糖部分被切去形成苷元，然后被吸收進入血液中發揮其藥理作用。中草藥與益生菌種類非常龐大，因此篩選適于配伍的品種及合適的配比很重要。
5 益生素與活性肽配伍使用
    活性肽又叫小肽或寡肽，是由2~10個氨基酸組成的具有直鏈或環狀結構的肽，機體對氨基酸與活性肽存在著不同的吸收機制，動物對蛋白質的需要不能完全由游離的氨基酸來滿足，還需要一定數量的能完整被機體吸收的活性肽(一般指二肽或三肽)。從氨基酸平衡的角度來考慮，當外源氨基酸不能滿足畜禽需要的時候，可考慮在日糧中添加活性肽類物質使其直接參與蛋白質的合成，提高蛋白利用率。活性肽具有免疫調節、抗菌等作用，能提高機體的免疫力。如β-酪蛋白水解產生的肽可促進巨噬細胞的吞噬作用。從豬小腸中分離出一段NK-賴氨酸寡肽以及乳鐵蛋白和大豆蛋白的酶水解產物中的肽對大腸桿菌有抑制作用。此外活性肽還可以增強益生菌的益生效果，刺激發酵糖和淀粉的微生物生長。益生菌在生長過程又能反過來促進活性肽的產生吸收及利用。這是由于大多數益生菌能產生蛋白酶幫助機體將蛋白質分解成許多活性肽，若活性肽的吸收與腸道pH產生聯系時，許多產酸益生菌生成的有機酸類物質能穩定腸道pH，從而促進活性肽的產生，加速機體對其吸收利用效率。有研究表明，將肽和乳酸桿菌聯合使用作飼料添加劑，在降低腹瀉豬的死亡率、防治消化道疾病、提高生長速度方面有很好的效果，且比單一使用乳酸桿菌或肽日增重提高10%，腹瀉率降低50%，死亡率降低33%。
6 益生素與特異性疫苗配伍使用
    益生素與特異性疫苗組合使用顯示出很好的協同效應。益生素可提高動物機體的免疫準備狀態。畜禽服下益生素后，通過排斥病原菌，調整腸道菌群使腸道微生態系統處于最佳的平衡狀態，同時各正常菌群在腸道具有抗原識別位點的淋巴組織集合上發揮免疫佐劑作用，活化腸黏膜內的相關淋巴組織，使分泌免疫球蛋白抗體分泌增強，提高抗體免疫識別力，并誘導產生細胞因子，進而活化全身免疫系統，當機體接受特異性的疫苗免疫、抗原刺激時，則可促進動物產生高水平的特異性抗體，從而提高動物的抗病力。
    另外特異性疫苗進入畜禽體內殺滅有害菌，又間接提高了益生菌在機體內的競爭優勢及相對數量，有利于其定植生長，發揮功效。
7 小結
    益生素除了與上述物質配伍外，還可與螺旋藻、大蒜素、大豆黃酮等物質協同發揮功效，但益生素與這些添加劑之間的協同機理并不清楚，這也是未來研究的一個重要方向。另外，隨著益生素與其他綠色飼料添加劑配伍使用的功效越來越被認可和接受，需在益生素與其他飼料添加劑配伍的種類選擇、添加比例等方面應加強研究，充分發揮其協同優勢，更好地為畜禽水產養殖業的快速、健康、全面發展作出貢獻。